我们在协助企业申请高新技术企业认定的过程中，发现最多的问题是：

1、知识产权证明材料存在问题。比如知识产权所有人系公司法人代表而不是法人（务必与公章一致），知识产权不是近3个会计年度获得的授权等。

2、研发费用比例不符合规定要求。偏低自然不符合《高新技术企业认定管理办法》的规定要求，偏高则明显的不符合逻辑思维。企业日常财务工作就应注意，在管理费用中下设研发费用的二级科目，根据会计准则研发费用的规定范畴进行日常的研发费用归集，并将独立的研发费用台账。

3、高新收入占全年收入比例胡编乱造，注意一定得符合常人的思维和推断。

4、其他在财务方面的问题。如审计报告上的销售售入与汇算清缴上的数据不一致，虽然有的另附说明也合情合理，但总免不了偷税漏税的嫌疑。其实完全不必另附说明，直接在审计报告附注上披露相关信息就可以了。

针对以上问题，我们的建议是：

1、提前策划。提前咨询并启动高新认定工作是比较明智的选择，因为涉及到税收优惠政策或者企业发展战略比如上市计划，不要因高新认定而受到影响。

2、自我评价。启动后尽快对企业自身情况进行评价，或者聘请专业机构进行评估，了解企业所缺乏的方面，明确申报的重点工作，及时补充企业不足的资料。

3、及早申请知识产权。申请知识产权必须走流程，这很花费时间，若是启动较晚，会导致后续花费不必要的开支或者直接推迟1年，专利12月31号与次年1月1号获得授权结果就大相径庭。

4、合理规划研发项目和研发费用。安排公司研发人员对公司近三年的研发项目进行规划，从中挑选或者细分适当数量的优质项目进行上报，并在此基础上由企业的财务人员对研发费用进行归集，以便确定是否能够达到相应的比例。

5、随时关注高新认定的新政策。《高新技术企业认定管理办法》预留了足够的空间，认定机构可松可紧收放自如，会不断发生变化，在实际认定中难免会有从严执行的情况，因此最好保持和认定机构的及时沟通和联系，随时了解高新认定的政策非常必要。